数据库对比

概述

参考:

GreptimeDB vs. ClickHouse vs. ElasticSearch 日志引擎性能对比报告

原文: https://mp.weixin.qq.com/s/eITHYdw8Qoa0xYozqJZuOw

GreptimeDB 在 v0.9 版本引入了日志存储和检索功能,使得用户可以使用同样数据模型和查询语言(SQL)来统一处理指标、日志(和事件)。

本报告将初步给出 v0.9 首次引入的日志存储和检索的单机性能,包括写入和查询性能、资源占用和压缩率等。在可观测性领域中,常用的日志系统包括经典的 ELK 组合(ElasticSearch)以及在国内广泛使用的 ClickHouse。我们选择这两个系统进行横向对比,以供参考。GreptimeDB 面向云原生环境设计,因此我们也测试了基于 S3 对象存储的读写性能。

测试场景

测试数据和流程

我们选用 nginx access log 作为写入数据,一行数据的样例如下:

129.37.245.88 - meln1ks [01/Aug/2024:14:22:47 +0800] "PATCH /observability/metrics/production HTTP/1.0" 501 33085

我们使用 vector[1] 这个开源可观测数据 pipeline 来生成并写入上面的数据。整体测试的流程如图:

数据写入后,我们分别使用 SQL(GreptimeDB 和 ClickHouse)和  ElasticSearch HTTP 协议进行查询测试。

写入方式

写入方式我们也做了区分:

  • 切分模式:将每行日志,切分出多个字段,比如上面这行日志,可以切分出 http_versionipmethodpathstatus 等字段。我们同样使用 vector 进行日志的解析和切分;
  • 全文模式:将该条日志,除了时间戳以外,完整存储为一个 message 的文本字段,并启用全文索引。

我们也将比较两种模式带来的差异。

软硬件说明

硬件环境

机器规格操作系统
aws c5d.2xlarge, 8 CPU 16 Gib memoryubuntu 24.04 LTS

软件版本及设置

GreptimeDBv0.9.2
ClickHouse(下文统称 CH)24.9.1.219
ElasticSearch(下文统称 ES)8.15.0

如无特殊说明,三个存储都采用默认配置

GreptimeDB S3 配置,开启了对象存储的读写 Buffer/Cache:

[storage]type = "S3"bucket = "ap-southeast-1-test-bucket"root = "logitem_data"access_key_id = "xxx"secret_access_key = "xxx"endpoint = "endpoint"region = "ap-southeast-1"cache_path = "/home/ubuntu/s3cache"cache_capacity = "20G"[[region_engine]][region_engine.mito]enable_experimental_write_cache = trueexperimental_write_cache_size = "20G"

切分模式设置

Vector 解析配置:

[transforms.parse_logs]type = "remap"inputs = ["demo_logs"]source = '''. = parse_regex!(.message, r'^(?P<ip>\S+) - (?P<user>\S+) \[(?P<timestamp>[^\]]+)\] "(?P<method>\S+) (?P<path>\S+) (?P<http_version>\S+)" (?P<status>\d+) (?P<bytes>\d+)$')# Convert timestamp to a standard format.timestamp = parse_timestamp!(.timestamp, format: "%d/%b/%Y:%H:%M:%S %z")# Convert status and bytes to integers.status = to_int!(.status).bytes = to_int!(.bytes)'''

GreptimeDB 建表语句:

--启用了 append 模式,并且将 user、path 和 status 设置为 Tag 类型(即主键)CREATE TABLE IF NOT EXISTS `test_table` (    `bytes` Int64 NULL,    `http_version` STRING NULL,    `ip` STRING NULL,    `method` STRING NULL,    `path` STRING NULL,    `status` SMALLINT UNSIGNED NULL,    `user` STRING NULL,    `timestamp` TIMESTAMP(3) NOT NULL,    PRIMARY KEY (`user`, `path`, `status`),    TIME INDEX (`timestamp`))ENGINE=mitoWITH(    append_mode = 'true');

ClickHouse 建表语句:

--使用默认 MergeTree 引擎,定义同样的 sorting key。CREATE TABLE IF NOT EXISTS test_table(    bytes UInt64 NOT NULL,    http_version String NOT NULL,    ip String NOT NULL,    method String NOT NULL,    path String NOT NULL,    status UInt8 NOT NULL,    user String NOT NULL,    timestamp String NOT NULL,)ENGINE = MergeTree()ORDER BY (user, path, status);

ElasticSearch 建表语句 (mapping):

{  "vector-2024.08.19": {    "mappings": {      "properties": {        "bytes": {          "type": "long"        },        "http_version": {          "type": "text",          "fields": {            "keyword": {              "type": "keyword",              "ignore_above": 256            }          }        },        "ip": {          "type": "text",          "fields": {            "keyword": {              "type": "keyword",              "ignore_above": 256            }          }        },        "method": {          "type": "text",          "fields": {            "keyword": {              "type": "keyword",              "ignore_above": 256            }          }        },        "path": {          "type": "text",          "fields": {            "keyword": {              "type": "keyword",              "ignore_above": 256            }          }        },        "status": {          "type": "long"        },        "timestamp": {          "type": "date"        },        "user": {          "type": "text",          "fields": {            "keyword": {              "type": "keyword",              "ignore_above": 256            }          }        }      }    }  }}

全文模式设置

GreptimeDB 建表语句:

--message 列启用 FULLTEXT 选项,开启全文索引CREATE TABLE IF NOT EXISTS `test_table` (    `message` STRING NULL     FULLTEXT WITH(        analyzer = 'English',         case_sensitive = 'false'    ),    `timestamp` TIMESTAMP(3) NOT NULL,    TIME INDEX (`timestamp`))ENGINE=mitoWITH(    append_mode = 'true');

ClickHouse 建表语句:

--同样指定 message 列建立全文索引CREATE TABLE IF NOT EXISTS `test_table` (    `message` STRING NULL     FULLTEXT WITH(        analyzer = 'English',         case_sensitive = 'false'),    `timestamp` TIMESTAMP(3) NOT NULL,    TIME INDEX (`timestamp`))ENGINE=mitoWITH(    append_mode = 'true');

ElasticSearch:

{  "vector-2024.08.19": {    "mappings": {      "properties": {        "message": {          "type": "text",          "fields": {            "keyword": {              "type": "keyword",              "ignore_above": 256            }          }        },        "service": {          "type": "text",          "fields": {            "keyword": {              "type": "keyword",              "ignore_above": 256            }          }        },        "source_type": {          "type": "text",          "fields": {            "keyword": {              "type": "keyword",              "ignore_above": 256            }          }        },        "timestamp": {          "type": "date"        }      }    }  }}

写入性能

不限速写入 1 亿条数据:

切分模式全文模式
写入耗时(分钟)平均 TPS写入耗时(分钟)平均 TPS
GreptimeDB13.1127,22617.595,238
GreptimeDB on S313.2126,26216.2102,881
ClickHouse10166,66712.2136,612
ElasticSearch42.339,40159.428,058
  • 切分模式下,写入性能上 CH 最佳, GreptimeDB 本地磁盘模式和 S3 模式写入性能相当,都在 12~13 万行每秒左右, ES 最差,并且差距较大,仅为 GreptimeDB 的 1/3, ClickHouse 的 1/4
  • 全文模式下,整体横向对比结论不变,但是写入性能都有所下降,GreptimeDB 下降 25%,ClickHouse 下降 18%,ES 下降 29%,可见全文索引对写入的影响不小

资源占用和压缩率

资源占用

为了观察写入过程中的资源占用,我们将写入速度限速为 2 万行每秒,然后采集 CPU 和内存占用情况:

切分模式全文模式
CPU(%)Memory(MB)CPU(%)Memory(MB)
GreptimeDB33.2437716.79462
ClickHouse8.9158932.97632
ElasticSearch56.0312,38165.408,782

可以看到:

  • 切分模式下,ClickHouse 的 CPU 消耗最低,GreptimeDB 其次, ES 消耗较高,是 CH 的 6 倍, GreptimeDB 的 1.7 倍,内存上 GreptimeDB 消耗最低, ClickHouse 其次,而 ES 的内存占用超过了 12 G,是 CH 的 21 倍, GrptimeDB 的 32 倍
  • 全文模式下,无论是 CPU 还是内存,都是 GreptimeDB 最优,其次 ClickHouse,ES 仍然是消耗最高的,尤其是内存
  • 测试过程中发现 ClickHouse 的 CPU 波动最大,最高可以到 139%。

这个结果其实跟三者的架构,以及针对优化的场景有关,我们最后再分析。

压缩率

原始 10 亿条数据在 10 GB 大小左右,我们再来看下三者的压缩率:

切分模式全文模式
磁盘占用(GB)压缩率磁盘占用(GB)压缩率
GreptimeDBdata1.313%3.333%
ClickHouse压缩前7.615.5
压缩后2.626%5.151%
ElasticSearch压缩前14.619.0
压缩后10.2102%17.2172%

由于 ClickHouse 和 ES 在写入完成后会持续对数据进行压缩,我们这里同时记录刚写入完成和数据大小不再变化后的数据大小。可以看到:

  • 任何模式下, GreptimeDB 的压缩率都是最好的,切分模式下是原始数据的 13%,全文模式下是原始数据的 33%。 ClickHouse 其次,也都比原始数据更小,而 ES 最差,由于索引构建的开销,整体数据都比原始数据更大;
  • 切分模式下的压缩率都好于全文模式。 切分模式下,更多的列被提取出来,而 GreptimeDB 存储引擎是列存,因此压缩率更优。

查询性能

查询场景

我们将查询场景区分为 6 个,覆盖比较典型的日志使用场景:

1. Count 统计查询:统计全表数据行数;
2. 关键词匹配查询:匹配日志中的 user、method、endpoint、version、code 分别为特定值;
3. 区间统计查询:使用时间范围统计约一半(5,000 万行)数据量的查询;
4. 中间时间范围查询:取时间中间范围一分钟,并查询 1000 行数据;
5. 最近时间范围查询:取最近时间范围一分钟,并查询 1000 行数据;
6. 关键词匹配 + 区间查询:查询特定时间范围内的字段匹配结果。

GreptimeDB 和 ClickHouse 都使用 SQL 进行查询,前者使用 MySQL 客户端工具,后者使用 CH 自身提供的命令行客户端[2]。

ElasticSearch 我们使用 search 的 REST API[3]。

切分模式查询性能

平均耗时 / 单位 msGreptimeDBGreptimeDB on S3ClickHouseElasticSearch
Count 统计查询774610
关键词匹配查询416952134
区间统计查询994107941316
中间时间范围49565632
最近时间范围784013325
关键词匹配 + 区间查询27495288

切分模式下,三者的查询性能大部分都很接近,都可以在 1 秒内完成查询,区间统计查询对于 GreptimeDB 和 ClickHouse 来说都需要扫表,比 ES 差的比较多,我们也在针对这一点做优化。GreptimeDB 在本地磁盘和 S3 模式下的查询性能基本一致。

全文模式查询性能

GreptimeDB 默认的全文索引配置是相对保守的,为了保持稳定的在线写入和查询性能,没有充分利用内存和 CPU。而 ClickHouse 和 ES 都会充分利用内存和索引,因此我们在这个模式下还提供了一个优化配置的结果,我们修改了 GreptimeDB 下列两个配置:

  • page_cache_size = “10GB”,增大 SST 的 page cache 大小到 10GB;

  • scan_parallelism = 8,扫描 SST 的并行数,默认为 CPU 数的四分之一,调整到 8 以使用所有的 CPU 核心;

  • 我们也提供了默认配置下的查询结果:

平均耗时 / 单位 msGreptimeDBGreptimeDB on S3GreptimeDB 默认设置ClickHouseElasticSearch
Count 统计查询878439
关键词匹配查询99498655962080161
区间统计查询16031101149357210
中间时间范围162484636945126
最近时间范围4451742960622
关键词匹配 + 区间查询93058653731610122

GreptimeDB 默认配置的查询性能除了最近时间范围查询以外都最差,在修改默认配置后,所有查询耗时都可以在 1.6 秒内完成,部分查询比 CH 更快,比如最常见的关键词匹配+时间区间范围查询。ES 的查询性能最优,较大的内存占用和更优化的索引实现带来来更好的查询性能, CH 表现较为均衡。

GreptimeDB 正在持续优化查询性能,未来预计默认配置将达到与 ClickHouse 相当的水平,敬请期待。

总结

通过测试,我们得出以下结论:

  • GreptimeDB 的日志引擎在写入性能、资源占用和压缩率方面表现出色,CH 较为平衡,而 ES 在这些方面表现最差且资源消耗高。
  • 查询性能方面,切分模式下 GreptimeDB 与 CH 和 ES 相当。全文模式下,GreptimeDB 表现一般,但优化后可在 1.6 秒内完成大部分查询。ES 查询性能最佳,CH 较为均衡。
  • GreptimeDB 在本地磁盘和 S3 对象存储模式下性能基本一致。
  • 切分模式(日志结构化)提升了读写性能和压缩率。GreptimeDB 和 ES 都具备 Ingestion Pipeline 功能,可将非结构化文本转换为结构化数据[4][5]。

这个结果其实跟三者面向的场景紧密相关:

  1. GreptimeDB 为面向在线的可观测应用而设计,比如智能运维和监控场景,尤其是海量数据,比如车联网或者大规模的监控系统,并且提供了数据直接保存在对象存储的能力。由于在线监控需要持续可用,因此 GreptimeDB 对于资源的使用会相对谨慎和控制,更希望提供稳定 7x24 读写服务,并具备良好的水平扩展能力。
  2. ClickHouse 面向离线数仓服务设计,离线数仓很多是 ad hoc 查询或者长时间范围的数据分析,对查询耗时和失败率没有那么敏感,CH 更充分地利用 CPU 和内存等资源。
  3. ElasticSearch 专为在线或离线检索业务而设计,具备良好的索引能力和完备的搜索功能(基于优秀的 Apache Lucence 项目),更加激进地使用资源,尤其是内存和磁盘占用,但是相对的,消耗的资源也是最大,写入性能也较差。

简而言之,在海量日志场景下, GreptimeDB 是一个性价比最高的选择,基于云原生架构,可以用更低的资源消耗(CPU、内存和磁盘)来承载大量日志的存储,并且具备优秀的水平扩展能力,但是作为首个版本实现,查询性能相对一般,还需要持续优化。ClickHouse 也是较为优秀的选择,只是 ClickHouse 仍然是传统的分布式架构设计,没有办法充分地利用云的基础设施,尤其是弹性和廉价对象存储。而 ES 则更适合面向在线的搜索业务,对于延时和结果排序更为敏感,日志场景不是合适的选择,资源消耗和写入性能都最差。最后,CH 和 ES 的分布式集群的运维部署都相当繁琐。

GreptimeDB 的日志引擎目前还是第一个版本,我们将持续优化,敬请关注!


最后修改 September 26, 2024: database, i/o (432e6e5d)